藥物在應用過程中出現與其作用完全相反的矛盾現象,被稱為藥物矛盾反應(paradoxical reaction)。例如被鎮靜劑所刺激,或是被興奮劑鎮定。

藥物矛盾反應易導致診斷和處理錯誤,誤認為病情惡化或藥量不足而增加藥物劑量,導致嚴重後果。如應用大劑量青黴素治療全身嚴重感染,也可出現藥物矛盾反應。應用大劑量青黴素後,敏感菌被殺死而釋放大量內毒素,導致變態反應,引起體溫暫時性升高,易誤認為是細菌對青黴素耐藥。抗感染藥物引起的二重感染也是藥物矛盾反應。

可產生矛盾反應的藥物還有抗過敏藥致過敏反應:抗組胺藥苯海拉明、異丙嗪(非那根)、氯苯那敏(扑爾敏)等,主要是用於治療皮膚粘膜變態反應性疾病。但個別患者應用後,有時可發生過敏性皮炎、光敏感性皮炎和藥疹等。

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